在英格兰与旅行无关的戊型肝炎和威尔士:人口,临床和分子 流行病学特征外文翻译资料

 2022-12-30 12:12

在英格兰与旅行无关的戊型肝炎和威尔士:人口,临床和分子

流行病学特征

Samreen Ijaz,1 Eve Arnold,2 Malcolm Banks,8 Richard P.Bendall,4 Matthew E.Cramp,6 Richard Cunningham,7Harry R.Dalton,5 Tim J.Harrison,3 Simon F.Hill,9 Lorna MacFarlane,10 Rolf E. Meigh,11Shuja Shafi,12Martin J.Sheppard,13 Jacquie Smithson,14 Melanie P.Wilson15和Chong-Gee Teo 1。1病毒参考部门和2统计单位,卫生保护局感染中心,3伦敦伦敦大学学院温迪尔医学科学研究所,4临床微生物学和5消化科,特鲁罗皇家康沃尔医院,6消化内科和7普利茅斯市Derriford医院微生物科,新霍夫兽医实验室机构8哺乳动物病毒学,9普尔市普尔医院微生物学部,国家公共卫生服务微生物科10阿伯里斯特威斯市,阿伯斯威斯总医院,阿伯里斯特威斯市,11英国科廷汉姆希尔医院,哈罗市Northwick Park医院微生物科12,哈弗福韦斯特Withybush总医院微生物科13,赫尔皇家医院消化内科14,县赫里福德郡医院微生物科15

摘要:在1996年至2003年之间,通过血清学诊断出186例戊型肝炎病例。 在这些人中,有17人(占9%)与近期出国旅行无关。 患者年龄为1 55岁(56-82岁),倾向于男性(76%)。 两名患者出现暴发性肝炎。 最近有129例(69%)与最近去往戊型肝炎病毒(HEV)高流行国家的旅行有关。 与旅行相关疾病的患者相比,非旅行相关疾病的患者更可能年龄较大,居住在沿海或河口地区,而不是南亚种族,并感染了HEV基因型3株。 基因型3亚基因组核苷酸序列是独特的,并且与来自英国猪的那些密切相关。 英格兰和威尔士原住民受HEV感染的患者往往属于不同的人口群体,有多种感染源,猪可能是病毒库。

戊型肝炎是由戊型肝炎病毒(HEV)引起的,戊型肝炎是与杯状病毒密切相关的非肠道传播的病毒[1]。在亚洲,非洲和中美洲的卫生条件较差的地区,戊型肝炎的偶发性暴发很普遍,偶尔会通过水传播传播大流行病[2]。在年轻人中,特别是在孕妇中,其临床感染率最高,后者的死亡率也很高[3]。在工业化国家中,该病相对少见,并且主要影响到在HEV流行病低发地区旅行的人[4]。在发达国家,如新西兰[5],澳大利亚[6],美国[7],希腊[8],奥地利[9],意大利等,没有最近出国旅行史的人中戊型肝炎的病例已有报道。 [10],英国[11-13],荷兰[14],法国[15、16],西班牙[17],德国[18],台湾[19]和日本[20、21] 。在日本,已观察到暴发性戊型肝炎导致的死亡[20,21]。在这些国家,HEV亚基因组测序研究表明,感染人类的​​菌株与感染猪的菌株之间存在密切的关系[20,22-24]。而且,实验数据已经证明了猪和人之间戊型肝炎病毒的传播[25]。这些发现支持这样的观点,即工业化国家中的戊型肝炎是从猪传播给人的人畜共患病。在日本,这种传播可能与未煮熟的猪肝[26]和未煮熟的肉[27、28]的食用有关,但西方国家的人除了去往高流行性病毒国家之外,如何获得戊型肝炎仍然令人困惑。通过对第一个已知病例的研究结果[12、13、24],我们对英格兰和威尔士的戊型肝炎患者进行了研究,以调查非旅行相关疾病的人口统计学,临床和分子流行病学因素。

患者,材料和方法

患者和样本。 1996年,中央公共卫生公共卫生实验室服务实验室(现称卫生保护局感染中心)简介-为戊型肝炎提供血清诊断测试服务样品使用HEV IgM和IgG ELISAs man-由Genelabs Technologies制造。疑似患者急性非甲非乙型肝炎,其样本被称为-对当年和2003年之间的时间进行了评估研究。纳入研究的患者是那些对抗HEV IgM和IgG呈阳性。患者前从研究中剔除的是那些抗HEV的血清反应阴性的抗体,其初始样品具有血清阳性抗HEV IgM,但不适用于抗HEV IgG,以及那些随访样本并未显示出抗-HEV IgG。有关患者的人口统计学和临床​​信息(年龄,性别,生病前三个月的旅行历史,居住地并生病)是从SAM随附的推荐表格上提供的数据-ples。居住地被指定为沿海或河口,根据邮政编码是否在沿海地区或河口定居点或海岸或河口10公里以内,并且因为它位于密集的养猪场中母猪和小母猪是1 10/100公顷耕地[29]。南Pehchan软件用于在姓氏的基础[30];种族被分类为南亚或非南亚人。对于没有报告过前期药的患者-的旅行,进一步的询问是通过医疗审查记录,与转诊的临床实践相对应-或与患者进行电话采访。目的该询问是为了确定疾病的结果并确定患者是否从事了可能的活动使他们面临购买HEV的风险-即进入与患者黄疸的人接触,吃贝类,不食用煮熟的动物产品,饲养宠物并进行联系用活猪。

HEV基因组扩增。可用的血清样本可以确定出行史的患者用于HEV基因组检测和表征。总使用QIAamp从200 mL血清中提取总RNAUltraSens病毒试剂盒(Qiagen)。逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)如前所述进行[22]。简而言之,用反义简并引物3157(5rsquo;-CCCTTATCCTGCTGAGC-ATTCTC-3rsquo; )使用SuperScript II(Invitrogen)。然后使用引物3156(5-AAT [C] TATGCC [A] CAGTACCGGGTTG-3)和3157(5)扩增可读框2(ORF2)的304 nt片段的cDNA,该cDNA编码病毒衣壳基因。 -在第一轮PCR中使用CCCCTATCCTGCGCAGAGTCTCTC-3以及引物3158(5-GTT [C] ATGC [T] TT [C] TGCATA-CATGGCT-3)和3159(5-AGCCGACGAAATC [T] AATTCT- GTC-3)在第二轮PCR中。 这两轮的PCR循环条件包括:在94℃变性1次,在42℃退火1分钟,在72℃延伸2分钟的39个变性循环。

核苷酸序列分析。使用GFX PCR DNA和凝胶带纯化试剂盒(Amersham Biosciences)纯化所有PCR产物。 使用PCR内部引物和Beckman CEQ8000测序仪对两条链进行测序,然后使用DNAstar(5.03版; Lasergene)组装并分析产生的核苷酸序列。 进行核苷酸序列的比对,分析和展示以确定在本研究中鉴定的HEV序列与从GenBank检索到的HEV序列之间的系统发育关系。 数据的鲁棒性是通过使用SEQBOOT,DNADIST,CONSENSE(PHYLIP软件包版本3.6)和NEIGHBOR的邻居连接方法(PHYLIP软件包版本3.6)对序列比对(1000套)进行自举重采样来确定的。 大于70%的引导值包含在最大似然树中。

统计分析。根据旅行史对患者进行分类。 使用SAS(版本8.2; SAS)进行Logistic回归分析,并用于检查旅行历史和人口统计因素之间的可能关联。 通过使用Fisher精确检验的敏感性分析,分别分析了旅行史和HEV基因型之间的关联。 在适当的情况下,采用Fisher精确检验来比较非旅行相关疾病患者的特征。

结果

戊型肝炎患者的旅行史。在1996年至2003年之间,对478例患者的样本进行了抗HEV IgM和IgG的检测。 共有186名患者符合诊断戊型肝炎的血清学标准。表1汇总了这些患者的年龄,性别和种族特征。报告最近去过戊型肝炎高流行地区(n = 129)的患者访问了孟加拉国。 (66),印度(30),巴基斯坦(25),阿富汗(3),尼泊尔(2),印度和孟加拉国(1),尼日利亚(1)和中国(1); 这些患者被分配为T组。报告最近前往HEV非高流行国家(n = 8)旅行的患者访问了西班牙(2),塞浦路斯(2),土耳其(1),美国(1),新西兰( 1)和乌干达(1)。 没有报告近期旅行史的患者(n = 17)被分配到NT组。 32名患者的旅行史未知。

非旅行相关的戊型肝炎患者。表2列出了NT组患者的人口统计学和临床​特征。所有患者均为白人。十(59%)岁大于65岁。所有这些患者均为男性,其中5名年龄大于75岁。男性(14/17)明显多于女性(3/17)(P = .01)。 15例患者出现黄疸。其余2例具有指示暴发性肝炎的临床特征。1例死亡,1例需要肝移植。 3例患者居住在密集的养猪场中,而14例患者则不在,而14例患者在沿海或河口地区,而3例则没有。除2名患者(配偶患者NT11和NT12)在生病之前习惯性养贻贝和蛤以外,没有患者报告生病前食用贝类。没有人回想起食用动物原料或与黄疸病患者或活猪接触。除1名养猫的患者外,没有其他养宠物的患者。

人口特征比较。比较NT组和T组患者的人口统计学特征。 NT组中没有一个是南亚裔的(NT组与T组相比,P lt;.0001)。Logistic回归确定了沿海地区或河口地区的年龄和居住地是与年龄相关的非旅行相关疾病的重要危险因素是居住地的一个令人困惑的变量。观察到NT组的几率随着年龄的增长以16%/年的速度增加(赔率[OR],1.16 [95%置信区间{CI} 1.07–1.25]; P lt;.0001)。在NT组中,生活在沿海或河口地区的患者是未居住在此类地区的患者的75倍(OR,74.9 [95%CI,6.9-815.9]; P = .0004)。 NT组和T组患者的性别分布差异不显着。居住在密集猪区的NT组患者比例(3/17)与T组患者(3/128)相比有显着差异(P = .02);与3个T组患者中的1个相比,居住在密集猪场的所有3组NT患者也都生活在沿海或河口地区。

HEV亚基因组核苷酸序列特征。HEV ORF2 cDNA可以从17例NT组的11名患者中(65%)和39例可进行RT-PCR的T组患者中的27名(69%)进行扩增。 NT患者属于基因型3,而所有来自T组患者血清样品的序列均属于基因型1(图1)。如果考虑到不足以进行扩增和测序研究的血清样品的未知基因分型结果,则基因型和旅行史之间的关联很显着(P lt;.001)。来自NT患者组的基因型3序列是独特的,与主要由欧洲HEV病毒株组成的亚组聚类,并且与主要源自美国,加拿大,台湾和日本的序列组成的亚组分开。产生的高自举值支持不同的亚组聚类。本研究衍生的序列与英国猪报道的序列之间的核苷酸同一性[13,24]范围为82%至95%,氨基酸序列同一性范围为99%到100%。 UK sw1和UK sw2 HEV的氨基酸序列相同;与之相比,来自患者NT2-NT7,NT10和NT11的氨基酸序列是相同的,来自患者NT1,NT8和NT9的氨基酸序列具有99%的同一性。

讨论

这项研究揭示了非旅行性戊型肝炎患者和在戊型肝炎高流行国家旅行时被感染的人群之间的人口统计学差异。NT组的所有患者均为白人,而T组的大多数患者为南亚种族。沿海地区或河口地区的老年和居住是获得非旅行相关疾病的重要危险因素。年龄对居住地的混杂影响与当代人口普查数据一致,该数据表明,超过州退休金年龄(男性65岁,女性60岁)的人中,很大一部分(gt; 20%)居住在墨西哥沿海地区。英国[31]。尽管两组中高比例的男性差异并不显着,但男性比例明显高于NT组女性,这表明男性是罹患非旅行相关疾病的危险因素。但是,这种明显的差异可能是由于该组的样本量较小。在感染2组的HEV基因型的分子流行病学特征上也发现了差异。亚基因组HEV核苷酸测序显示NT组NT患者仅被基因型3株HEV感染,而T组患者仅被基因型1的HEV感染。两组之间的差异表明,英格兰和威尔士的两种流行病学形式是戊型肝炎,这两种流行病学形式是共存的,非旅行相关形式表示本地感染,而旅行相关形式表示进口感染。

戊型肝炎仅是与旅行有关的疾病的看法可能会导致非旅行者诊断不足。 我们估计,在康沃尔郡,尽管当地对此病感兴趣(HRD和RPB,未发表的数据),但最多调查了20%的原因不明的肝炎的戊型肝炎。 甚至更低,这与本研究发现只有9%的戊型肝炎患者是非旅行者。

正在确定在工业化国家中获得非旅行相关的戊型肝炎的危险因素。 在猪兽医,与猪接触的农场工人和暴露于啮齿动物的流浪者中发现了高抗-HEV抗体血清阳性率。 在日本,食用未充分煮熟的猪肝[26]以及未充分煮熟或生的鹿和野猪肉[27,28]与一系列病例或共同来源暴发有关。 此外,有报道称,西班牙[17],西班牙,法国和美国的城市污水[34]和法国废水工作者的戊型肝炎[15]均从感染性HEV和病毒基因组中回收。 ],所有这些都指出了混合动力车有可能通过污水污染的水传播。 这些报告表明,在工业化国家,HEV可能通过食源,水传播和人畜共患病途径传播。

本研究的结果进一步表明,在英格兰和威尔士,几种戊型肝炎病毒的传播途径保持了戊型肝炎的流行性。在配偶(患者NT11和NT12)中同时发生戊型肝炎,他们报告食用惯常的贝类食用​​暗示该活动具有风险。因素,这与以前的传闻报道一致[35]。另外15名获得了非旅行相关的戊型肝炎的患者没有报告类似的行为,因此在这些感染中暗示了其他传播方式。这些患者中很大一部分是老年男性。显然,这部分患者不是从共同来源感染的,因为HEV亚基因组核苷酸序列表明存在许多亚基因组菌株。鉴于这些患者的人口统计学特征不同,他们可能有共同的感染途径。我们的调查还不够详尽,无法发现所有风险因素。例如,没有饮食史

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